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点击次数:7867 发布时间:2012/9/18 15:30:01
:plko.1-trc克隆载体
财团的干扰
1的plko。克隆载体骨干,技术联盟(券)建了一个图书馆的发夹针对15000人和15000小鼠基因。addgene正与真相与和解委员会使这个状克隆载体提供给科学界。请举北陆等人。,2006月;124(6):1283-98(医学)在所有出版物引起使用这种载体。
1 plko数码地图。
plko。1是一个不称职的慢病毒载体选择的真相与和解委员会表达发夹。plko。1可引入细胞通过直接转染,或可转换成慢粒子随后感染的靶细胞系。一经推出,嘌呤霉素抗性标记编码plko 1允许方便稳定的选择。
图1:图1 plko含有状插入。原plko.1-trc克隆载体有一1.9kb填充物是由消化上井和限制性。状核苷酸克隆到上井和限制性网站中的填充物。在上井现场销毁在大多数情况下(取决于靶序列),而限制性网站保存。一个完整的地图plko。1载1.9kb填塞,访问www.addgene.org/10878。
描述向量元素
U 6人U 6启动子驱动聚合酶转录三代状记录。
cppt中央polypurine道,cppt,改善传导效率,促进核进口的载体”的国家的复杂的细胞的转。
hpgk人力磷酸激酶启动子驱动表达嘌呤。
嘌呤霉素抗性基因选择是选择plko 1质粒在哺乳动物细胞中。
3 ''ltr 3 ' '钝长末端重复。
F1山F1细菌复制的起源。
安培的氨苄青霉素抗性基因选择plko 1质粒在细菌细胞。
市局山市局细菌复制的起源。
5 ''ltr 5 '长末端重复。
债转速反应元件。
图2:细节状插入。该U 6启动子指导核糖核酸转录聚合酶三状。状包含21个“意义”的基础是相同的目标基因,一个环包含一个xhoi限制的网站,和21的“反”的基础,是相辅相成的“意义”基地。状其次是polyt终止序列聚合酶三。
. 3的相关产品
以下质粒可从addgene建议使用与plko 1 trc-cloning向量。
质粒(addgene身份#)描述
plko。1 -真相与和解委员会的控制(10879)阴性对照载体插入发夹。
plko。1 -争夺状(1864)阴性对照载体炒状。
pspax2(12260)包装质粒生产病毒颗粒。
pmd2。克(12259)信封质粒生产病毒颗粒。
注:plko。1也可以用来与包装质粒和pcmv-dr8.2(addgene # 8455)和包膜质粒pcmv-vsvg(addgene # 8454)从罗伯特温伯格的实验室。更多信息,访问addgene '的哺乳动物干扰工具页。
其他几个实验室已经plko衍生载体,也可能是有用的实验。看到这些载体,访问addgene '的网站和搜索”plko”。
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B .设计为1 plko状寡核苷酸。
B . 1确定*佳21滨海目标在你的基因
选择合适的21滨海目标基因的步是有效的基因沉默。方法选择目标的不断提高。以下是建议为目标的选择。
1。使用中的选择工具来确定一组得分的目标,你的基因。例如,怀特海生物医学研究所主办了一个基因选择程序,可以访问后,免费注册(网址:/ /侏罗。我。麻省理工学院。”/ bioc / sirnaext /)。如果你有机会,另一个很好的程序irnai,这是免费提供的公司mekentosj(网址:http : / / / www.mekentosj。irnai /)。
总结准则设计的siRNA与有效的基因沉默是包含在这里:
从25nt下游的起始密码子(球蛋白),搜索21nt序列匹配模式机管局(n19)。如果没有合适的匹配,搜索纳尔(*新)ynn,没有任何核苷酸,是嘌呤(一,克),并是一个嘧啶(丙,你)。
气相色谱法的内容应该是36-52 %。
3’端应具有较低的稳定性–至少一一或之间的位置- 19。
避免针对内含子。
避免的4个或多个核苷酸重复,尤其是因为重复polyt是终止信号的核糖核酸聚合酶三。
2。减少退化的目标基因,利用美国的高炉项目。选择序列,至少有3个核苷酸错配的所有基因无关。
addgene建议你选择多目标序列为每个基因。一些序列将乙
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