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上海恒远告知:分析纯化的基本原理与操作步骤

点击次数:8626   发布时间:2014/3/17 10:55:56

 分离纯化的基本原理 :

研究基因的表达和调控时常常要从组织和细胞中分离和纯化RNA。RNA质量的高低常常影响cDNA库,RT-PCR和Northern Blot等分子生物学实验的成败。

     TRIzol试剂是一种新型总RNA抽提试剂,适用于从细胞和组织中快速分离RNA。内含异硫氰酸胍等物质,能迅速破碎细胞,抑制细胞释放出的核酸酶。TRIzol试剂有多组分分离作用,与其他方法如硫氰酸胍/酚法、酚/SDS法、盐酸胍法、硫氰酸胍法等相比,特点是可同时分离一个样品的RNA\\DNA\\蛋白质.TRIzol使样品匀浆化,细胞裂解,溶解细胞内含物,同时因含有RNase抑制剂可保持RNA的完整性。在加入氯仿离心后,溶液分为水相和有机相,RNA在水相中。取出水相用异丙醇沉淀可回收RNA;用乙醇沉淀中间层可回收DNA;用异丙醇沉淀有机相可回收蛋白质。

 

操作步骤:

1. 匀浆处理:
a.组织处理  将文蛤的各个组织在液氮中磨碎,每50~100mg组织加入1ml TRIzol,用匀浆仪进行匀浆处理。样品体积不应超过TRIzol体积10℅。
b.单层培养细胞 直接在培养板中加入TRIzol裂解细胞,每10cm2面积(即3.5cm直径的培养板)加1ml,用移液器吸打几次。TRIzol的用量应根据培养板面积而定,不取决于细胞数。TRIzol加量不足可能导致提取的RNA受到DNA的污染。
c.细胞悬液离心收集细胞,每5~10×106动物、植物、酵母细胞或1×107细菌细胞加入1mlTRIzol,反复吸打。加TRIzol之前不要洗涤细胞以免mRNA降解。一些酵母和细菌细胞需用匀浆仪处理。

2.将匀浆样品在室温(15~30℃)放置5min,使核酸蛋白复合物完全分离。

3.由于样品中含有较多蛋白质,脂肪,多糖或胞外物质,因此在2~8℃10000rpm离心1min,取上清。离心得到的沉淀中包括细胞外膜,多糖,高分子量DNA,上清中含有RNA。处理脂肪组织时,上层有大量油脂应去除。取澄清的匀浆液进行下一步操作。

4. 每使用1ml TRIzol加入0.2ml氯仿,剧烈振荡15s,室温放置3分钟。

5. 2-8℃10000rpm离心15min。样品分为三层:底层为黄色有机相,上层为无色水相和一个中间层。RNA主要在水相中,水相体积约为所用TRIzol试剂的60℅。

6. 把水相转移到新管中,如要分离DNA和蛋白质可保留有机相,进一步操作见后。用异丙醇沉淀水相中的RNA。每使用1mlTRIzol加入0.5ml异丙醇,室温放置10min。

7. 2~8℃10000rpm离心10min,离心前看不出RNA沉淀,离心后在管侧和管底出现胶状沉淀。移去上清。

8. 用75℅乙醇洗涤RNA沉淀。每使用1ml TRIzol至少加1ml 75℅乙醇。2~8℃不超过7500rpm离心5min,弃上清。

9.室温放置干燥或真空抽干RNA沉淀,大约晾5~10min即可.不要真空离心干燥,过于干燥会导致RNA的溶解性大大降低。加入25~200μl无RNase的水或0.5℅SDS,用枪头吸打几次,55~60℃放置10分钟使RNA溶解。RNA可用100℅的去离子甲酰胺溶解,-70℃保存。

10.琼脂糖凝胶电泳对提取RNA产物进行检测。

 

原创作者:上海恒远生物技术发展有限公司

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